年9月11日
IDseq?从一位新生儿患者脑脊液样本中，检出无乳链球菌(Streptococcusagalactiae，GBS)特异性序列数条，检出病原体疑似与新生儿脑膜炎有关。
图1无乳链球菌检测序列数列表
图2无乳链球菌检测覆盖图
无乳链球菌病原体特征
无乳链球菌，也称B族链球菌，属于链球菌属，革兰阳性球菌，基因组大小约在1.9Mb-2.2Mb。无乳链球菌可定植于下人体生殖道和胃肠道[1]，触酶试验阴性，溶血性因子（CAMP）试验阳性。根据表面荚膜多糖可将无乳链球菌分为十种血清型（Ia、Ib、II、III、IV、V、VI、VII、VIII、IX），引起疾病的主要血清型因地区而异，并因侵入性和定植分离株而异[2]。
临床特征
1.早发感染：
由婴儿受到产道中细菌感染引起。感染发生在出生后第一周，患者平均发病年龄为20h。临床表现包括呼吸窘迫、嗜睡和低血压。1/3到一半的婴儿发生肺炎和或呼吸窘迫综合征，1/3发生脑膜炎，基本上所有早发感染的婴儿都会有败血症。
2.迟发感染：
多为母亲产后并发症引起。感染发生在出生1周至3个月大的婴儿身上，极少数情况下，也可以发生在更大的婴儿身上（平均发病年龄为3-4周），以败血症和脑膜炎为多见。菌型以Ⅲ型为多，特别是脑膜炎，90%以上为III型GBS引起。病死率比早期发病者低，脑膜炎的病死率为14%左右。
3.成人侵袭性GBS病：
图3微远基因10万+临床样本中
不同样本类型检出无乳链球菌的比例（%）
此外，GBS还可以与其他微生物引起成人肺部混合感染、心内膜炎、皮肤和软组织感染、骨髓炎或尿路感染等。微远基因10万+临床样本中无乳链球菌在脑脊液中检出13.48%，排名仅次于呼吸道样本，其他样本类型的检出数据如图3所示。
联合mNGS技术可提高无乳链球菌检出率
图4通过常规检测方法与常规检测方法+mNGS联合
检测出不同病原体的病例数（例）
首都医科医院刘钢教授团队在JournalofInfection杂志（IF=6.）发表的文章中指出，对99例细菌性脑膜炎儿童患者的脑脊液进行检测，结果表明，相比于常规检测方法（培养+抗原检测），常规检测方法联合mNGS技术可将病原体检出率从55.6%提高到68.7%，其中无乳链球菌检出从11例提高到15例(图4)[3]。
参考文献
[1]BlairArmisteadet,al.ThedoublelifeofGroupBStreptococcus:Asymptomaticcolonizerandpotentpathogen.JMolBiol.Jul26;(16):–.
[2]VanessaN.Raabeet,al.GroupBStreptococcus(Streptococcusagalactiae).icrobiolSpectr.Mar;7(2):10./microbiolspec.GPP3--.
[3]VLing-YunGuoet,al.Detectionofpediatricbacterialmeningitispathogensfromcerebrospinalfluidbynext-generationsequencingtechnology.JInfect.Apr;78(4):-.
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